منابع نزدیک به شیخ محمد ثواب به «صدای هندوکش» تأیید کردهاند که وی در نتیجه یک حادثه ناگوار در منزلش به شهادت رسیده است. به گفته این منابع، فرزند وی هنگام پاککاری اسلحه به طور غیرعمدی یک مرمی فیر کرد که به سر شیخ محمد ثواب اصابت نمود. این رویداد در حالی رخ داد که شیخ محمد ثواب در مقابل فرزندش نشسته بود و پس از اصابت مرمی به شدت زخمی شد.
بر اساس اطلاعات بهدستآمده، شیخ محمد ثواب صاحب پس از این حادثه به شفاخانه ایمرجنسی کابل منتقل شد، جایی که تیم صحی تلاشهای زیادی برای نجات جان وی انجام داد. با این حال، به دلیل شدت جراحتها، وضعیت او وخیمتر شد و پس از مدتی بستری بودن، جان باخت.
منابع تأکید کردهاند که این رویداد کاملاً غیرعمدی بوده و از سوی هیچ فردی به قصد قتل صورت نگرفته است.