مولانا شجاعالدین در سخنرانی خود در نشست علماء که به دعوت مولانا فضلالرحمن، رهبر جمعیت علمای اسلام تحت عنوان «اتحاد العلماء» برگزار شده بود، به شدت از رژیم حاکم پاکستان انتقاد کرده و گفته گفت که دادن نام اسلامی به حکومت فعلی پاکستان موضوعی قابل بحث است.
وی افزوده: «ما فتوا خواهیم داد که بغاوت و خروج علیه حکومت اسلامی حرام است؛ اما شما بگویید حکومت اسلامی چیست.»
مولانا شجاعالدین با اشاره به حکومت فعلی پاکستان تأکید کرده که نمیتوان هر حکومتی را اسلامی دانست و به گفته او، در این زمینه باید بحث جدی صورت گیرد.
